Aceasta este aplicația Linux numită Digital Expression on the Web a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca dew_RC2.tar.bz2. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Digital Expression pe Web cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
Expresia digitală pe web
Ad
DESCRIERE
DEW este o platformă care permite utilizatorilor să exploreze datele ARN-Seq. Este inclusă o interfață grafică de utilizator bazată pe web.
Analiza se desfășoară ca atare: aliniamentele cu goluri sunt efectuate și corectate pentru lungime, PCR și părtinirea fragmentelor, astfel încât să fie estimată un fragment pe kilobază (eficientă) per milion de citiri (FPKM), precum și citirile mai simple pe kb per milion de citiri ( RPKM). Atunci când sunt furnizate cu mai multe izoforme și în modul „contextual”, corecțiile includ un algoritm de maximizare a așteptărilor care estimează profilurile de expresie eficiente și se produce o aliniere corectată. Pentru fiecare genă furnizată de utilizator, DEW calculează statistici descriptive de acoperire (RPKM, FKMP și total, medii și mediană corectate), profiluri de expresie (normalizate ca R/FPKM și media tăiată a modificării pliilor). DEW permite utilizatorilor să exploreze datele prin furnizarea de grafice interactive.
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Bazat pe Web
Limbaj de programare
Perl, JavaScript, S/R
Mediul bazei de date
SQLite
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/dew/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
