Aceasta este aplicația Linux numită FPF a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca FPF_Linux.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită FPF cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
FPF
DESCRIERE:
Cuantificarea relativă de etichetare izobară este una dintre tehnologiile dominante de cuantificare proteomică. Conductele tradiționale de cuantificare pentru datele MS marcate cu izobar se bazează pe căutarea în baza de date a secvenței. Prezentăm o nouă conductă de cuantificare care integrează căutarea în baza de date de secvențe, căutarea în biblioteci spectrale și un filtru de potrivire a spectrului de peptide (PSM) bazat pe caracteristici (FPF) care utilizează diferite caracteristici spectrale pentru filtrare. Căutarea combinată a bazei de date și a bibliotecii spectrale are ca rezultat o acoperire mai mare de cuantificare, iar filtrul elimină PSM-urile cu erori de cuantificare mai mari, reținându-le pe cele cu o precizie mai mare de cuantificare. Conducta propusă este pe deplin compatibilă cu Trans-Proteomic Pipeline și poate fi executată pe platformele Windows, Linux și MacOS.
DESCRIERE
- proteomica
- cuantificarea etichetării izobare
- căutarea bibliotecii spectrale
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/comics-fpf/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.