Aceasta este aplicația Linux numită GENIE (GEne-geNe IntEraction) a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca GENIE_src.tar. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită GENIE (GEne-geNe Interaction) cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
GENIE (interacțiune gene-genă)
Ad
DESCRIERE
Interacțiunea genă-genă în studiile de asociere genetică este intensivă din punct de vedere computațional atunci când este implicat un număr mare de SNP. Majoritatea celor mai recente unități centrale de procesare (CPU) au mai multe nuclee, în timp ce unitățile de procesare grafică (GPU) au și sute de nuclee și au fost utilizate recent pentru a implementa software științific mai rapid. Cu toate acestea, în prezent nu există pachete software de analiză genetică care să permită utilizatorilor să utilizeze pe deplin puterea de calcul a acestor dispozitive multi-core pentru analiza interacțiunii genetice pentru trăsăturile binare.
Aici vă prezentăm un nou pachet de software GENIE, care utilizează puterea mai multor nuclee de procesor GPU sau CPU pentru a paraleliza analiza interacțiunii.
Referință: Chikkagoudar, S., Wang, K. și Li, M. (2011). GENIE: un pachet software pentru analiza interacțiunii genă-genă în studiile de asociere genetică folosind mai multe nuclee GPU sau CPU. Note de cercetare BMC, 4(1), 158.
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
C
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/gpugenie/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
