Aceasta este aplicația Linux numită Hamstr a cărei cea mai recentă versiune poate fi descărcată ca hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Hamstr cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
Hamstr
Ad
DESCRIERE
HaMStR s-a mutat la https://github.com/bionf/hamstr unde acum face parte din pachetul HaMStR-OneSeq.
HaMStR este un instrument bazat pe modelul Markov ascuns cu profil pentru o căutare direcționată a ortologului în EST sau în datele secvenței proteinelor. Programul ia ca intrare un grup de bază predefinit de secvențe ortologe (ortologi de bază) și un set de secvențe dintr-un taxon de căutare. HaMStR combină apoi, într-o strategie în doi pași, o căutare bazată pe pHMM și o căutare inversă prin BLAST pentru a extinde grupul ortolog de bază cu secvențe noi din taxonul de căutare.
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Perl
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/hamstr/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
