Aceasta este aplicația Linux numită Just_Preprocess_My_Reads pentru a rula în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Just_Preprocess_My_Reads pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
Just_Preprocess_My_Reads pentru a rula online în Linux
Ad
DESCRIERE
Identifică ARNr, contaminanți, trimuri într-un mod standard etc. Menține perechile citite. Creat pentru proiecte de mare capacitate (teraocteți de date).Utilizează pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (opțional)
DESCRIERE
- preprocesare luminoasă
- verificarea contaminării
Public
Știință/Cercetare
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.