Aceasta este aplicația Linux numită lr2rmats a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită lr2rmats cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
lr2rmats
DESCRIERE
lr2rmats este o conductă ușoară bazată pe Snakemake, care este proiectată să utilizeze atât datele ARN-seq de citire lungă de a treia generație, cât și cele de a doua generație de citire scurtă pentru a genera un fișier de adnotare genetică îmbunătățit. Fișierul de adnotare nou generat ar putea fi furnizat către rMATS pentru analiza alternativă diferențială de îmbinare.
Mai multe informații pot fi găsite la https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
DESCRIERE
- Citește mult
- ARN-seq
- Îmbinare alternativă
- Pacific Biosciences
- Tehnologii Oxford Nanopore
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
Shell Unix, Python, C
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
