Aceasta este aplicația Linux numită MarDRe a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca MarDRe-v1.4.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MarDRe cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
MarDRe
Ad
DESCRIERE
MarDRe este un instrument paralel bazat pe MapReduce de novo pentru a elimina citirile ADN duplicate și aproape duplicate prin gruparea secvențelor cu un singur capăt și cu un capăt pereche din seturile de date FASTQ/FASTA. Acest instrument permite bioinformaticii să evite analiza citirilor care nu sunt necesare, reducând timpul procedurilor ulterioare cu setul de date.
MarDRe este omologul Big Data al ParDRe (link de mai sus), care folosește tehnologii HPC (de exemplu, hibrid MPI/multithreading) pentru a reduce timpul de rulare pe sistemele multicore. În schimb, MarDRe profită de modelul de programare MapReduce pentru a îmbunătăți semnificativ performanța ParDRe pe sistemele distribuite, în special pe infrastructurile bazate pe cloud. Scris în Java pur pentru a maximiza compatibilitatea între platforme, MarDRe este construit pe proiectul open-source Apache Hadoop, cel mai popular cadru de calcul distribuit pentru procesarea Big Data.
Public
Tehnologia informației, industria sănătății, știință/cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal, linie de comandă
Limbaj de programare
Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/mardre/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
