Aceasta este aplicația Linux numită NGSReadsTreatment a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca NgsReadsTreatmentGI_v1.2.jar. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită NGSReadsTreatment cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
NGSReads Treatment
Ad
DESCRIERE
NGSReadsTreatment, un instrument de calcul pentru eliminarea citirilor duplicate în seturi de date cu un capăt pereche sau cu un singur capăt. NGSReadsTreatment poate gestiona citirile de pe orice platformă cu lungimi de secvență identice sau diferite. Folosind structura probabilistică Cuckoo Filter, citirile redundante sunt identificate și eliminate prin compararea citirilor cu ele însele. Astfel, nu este necesară nicio condiție prealabilă în afara setului de citiri. NGSReadsTreatment a fost comparat cu alte instrumente de eliminare a redundanței în analiza diferitelor seturi de citiri. Rezultatele au demonstrat că NGSReadsTreatment a fost mai bun decât celelalte instrumente atât în ceea ce privește cantitatea de redundanțe eliminate, cât și utilizarea memoriei de calcul pentru toate analizele efectuate.Notă: Pentru a rula noua versiune, utilizați Java versiunea 11.
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/ngsreadstreatment/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
