Aceasta este aplicația Linux numită SASHIMI a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca TPP_Setup_6.3.3.exe. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SASHIMI cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAPTURĂ DE ECRAN:
SASHIMI
DESCRIERE:
Proiectul Sashimi găzduiește Trans-Proteomic Pipeline (TPP), o suită matură de instrumente pentru proteomica bazată pe specificații de masă (MS, MS/MS): validare statistică, cuantificare, vizualizare și convertoare de la date brute MS la mzML/ deschis. formatele mzXML.
DESCRIERE
- Motoare de căutare în baze de date (cometă etc.)
- SpecraST (Motorul de căutare a bibliotecii de spectre)
- Căutare în masă deschisă (Magnum etc.)
- Kojak (Căutare încrucișată)
- Analiza DDA
- DISCo (analiza DIA)
- reSpect (analiza spectrului himeric)
- Cuantificare MS1 și MS2 Etichetat și neetichetat
- Generarea bazei de date Momeală
- PeptideProphet (validare la nivel PSM)
- iProphet (validarea nivelului de peptide)
- PTMProphet (validare după modificarea traducerii)
- Validarea nivelului de proteine
- Generarea bibliotecii de spectru
- Instrumente de vizualizare a datelor
- Catalogarea timpului de retenție și predicție
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Bazat pe web, linie de comandă
Limbaj de programare
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/sashimi/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.