Aceasta este aplicația Linux numită SnowyOwl, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca SnowyOwl-2.0.3.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SnowyOwl pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
SnowyOwl să ruleze online în Linux
DESCRIERE
SnowyOwl este o conductă de predicție genetică care utilizează date ARN-Seq pentru a antrena și a oferi indicii pentru generarea de predicții genetice bazate pe modelul Markov ascuns (HMM) și pentru a evalua modelele rezultate. Conducta a fost validată și simplificată prin compararea predicțiilor sale cu modele de gene curatate manual în trei genomi fungici, iar rezultatele sale arată creșteri substanțiale ale sensibilității și selectivității față de predicțiile anterioare ale genelor. Sensibilitatea este câștigată prin rularea în mod repetat a predictorului genei HMM Augustus cu parametri de intrare variați și selectivitatea prin alegerea modelelor cu cea mai bună omologie cu proteinele cunoscute și cel mai bun acord cu datele ARN-Seq. SnowyOwl a prezis cu succes genele în 26 de noi genomi fungici.Conducta poate fi instalată local pentru un randament ridicat și control asupra configurației. De asemenea, poate fi rulat pe un server la distanță printr-o interfață web convenabilă pentru utilizare ocazională.
DESCRIERE
- Predicția genelor folosind datele ARN-Seq
- Sensibilitate și specificitate ridicate
- Conductă simplificată și validată cu modele de gene selectate manual
- Foarte configurabil
- Configurație implicită pentru ciupercile ascomicete și basidiomicete
- Instalați și rulați local pentru control și flexibilitate
- Rulați de la distanță printr-o interfață web pentru confort
Public
Știință/Cercetare, utilizatori finali avansați
Interfața cu utilizatorul
Bazat pe web, linie de comandă, GTK+
Limbaj de programare
Python, PHP
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/snowyowl/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
