Aceasta este aplicația Linux numită SpiKeDeteKt a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca SpikeDetekt0.1.2.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SpiKeDeteKt cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SpiKeDeteKt
Ad
DESCRIERE
Acesta este un program de detectare automată a vârfurilor care ține cont de geometria sondei și produce un fișier .mask pentru a fi utilizat cu noua versiune mascata a KlustaKwik.
Vă recomandăm să utilizați Python 2.6 sau 2.7, de exemplu, o versiune academică gratuită poate fi obținută de la Entthought Python.
Fișierele de intrare pentru SpiKeDeteKt sunt:
.dat (fișier de date brute)
.probe (fișierul sondei, descris mai jos - construit de utilizator)
parameters.py (opțional - altfel folosește defaultparameters.py)
SpiKeDeteKt scoate următoarele fișiere:
.fet.n (fișier cu caracteristici)
.mask.n (necesar pentru utilizarea noului (mascat) KlustaKwik)
.clu.n (un fișier de indicii trivial în care totul este pus într-un singur cluster)
.fmask.n (de încercare - măști flotante în loc de binare, folosim aceasta pentru a testa KlustaKwik mascat)
.spk.n (fișier spike)
.upsk.n (formă de undă de vârf nefiltrată)
.res.n (lista timpilor de vârf)
.xml (un fișier xml cu toți parametrii care pot fi ulterior utilizați de neuroscop sau klusters)
.fil (date filtrate cu trecere înaltă)
.h5 (
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Piton
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/spikedetekt/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
