Aceasta este aplicația Linux numită Subread a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Subread cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
Subcitește
Ad
DESCRIERE
Pachetul software Subread este un set de instrumente pentru procesarea datelor de secvențiere de nouă generație. Include alinierea Subread, detector de joncțiune exon-exon Subjunc și programul de rezumare a citirii featureCounts.
Subread aligner poate fi utilizat pentru a alinia atât citirile gDNA-seq cât și ARN-seq. Alinierul subjunc a fost specificat conceput pentru detectarea joncțiunii exon-exon. Pentru maparea citirilor ARN-seq, Subread realizează aliniamente locale, iar Subjunc realizează aliniamente globale. Subread și Subjunc au fost publicate în următoarea lucrare: Yang Liao, Gordon K Smyth și Wei Shi. „The Subread aligner: rapid, precise and scalable read mapping by seed-and-vote”, Nucleic Acids Research, 2013, 41(10):e108
DESCRIERE
- citire alinier
- secvențiere de generație următoare
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
C
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/subread/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
