Aceasta este aplicația Linux numită SWAPHI: Smith-Waterman pe Intel Xeon Phi a cărei ultima versiune poate fi descărcată ca swaphi-v1.0.5.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SWAPHI: Smith-Waterman pe Intel Xeon Phi cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SWAPHI: Smith-Waterman pe Intel Xeon Phi
Ad
DESCRIERE
Primul algoritm paralel care accelerează căutarea în baza de date de proteine Smith-Waterman pe mai multe coprocesoare Intel Xeon Phi cu gazdă partajată. Căutând în baza de date UniProtKB/TrEMBL, SWAPHI atinge o performanță de până la 58.8 miliarde de actualizări de celule pe secundă (GCUPS) pe un singur Xeon Phi și până la 228.4 GCUPS pe patru Xeon Phi.
Public
Știință/Cercetare, Educație, Inginerie
Interfața cu utilizatorul
.NET/Mono, Consolă/Terminal
Limbaj de programare
C++, ALGOL 68
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/swaphi/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.