Aceasta este aplicația Windows numită FastQC a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca v0.12.1sourcecode.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită FastQC cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
CAPTURĂ DE ECRAN:
FastQC
DESCRIERE:
FastQC este un instrument de analiză de control al calității conceput pentru a identifica probleme potențiale în seturile de date de secvențiere de mare capacitate. Scopul său este de a oferi o modalitate simplă prin care să se verifice calitatea datelor brute de secvențe care provin de la conductele de secvențiere cu debit mare. Face acest lucru prin rularea unui set modular de analize pe unul sau mai multe fișiere de secvență brută în format fastq sau bam. Apoi produce un raport care rezumă rezultatele și evidențiază orice zone în care biblioteca poate părea neobișnuită. Acest lucru ar trebui să vă direcționeze apoi către locurile în care datele dvs. pot avea probleme și să vă permită să luați măsurile necesare pentru a le corecta înainte de a efectua orice analiză ulterioară.
FastQC nu este legat de niciun tip specific de tehnică de secvențiere, așa că poate fi folosit pentru a analiza biblioteci de diferite tipuri de experiment (Secvențiere genomică, ChIP-Seq, ARN-Seq, BS-Seq etc etc.).
DESCRIERE
- Importă date din fișiere BAM, SAM sau FastQ
- Oferă o privire de ansamblu rapidă care evidențiază zonele cu probleme potențiale
- Rezumat grafice și tabele pentru evaluarea rapidă a datelor
- Exportați rezultatele în HTML
- Poate fi folosit offline
Limbaj de programare
Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.