Aceasta este aplicația Windows numită Hadoop-BAM a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca hadoop-bam-7.1.0.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Hadoop-BAM cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
Hadoop-BAM
Ad
DESCRIERE
Hadoop-BAM este o bibliotecă Java pentru manipularea fișierelor în formate bioinformatice comune folosind cadrul Hadoop MapReduce cu Picard SAM JDK și instrumente de linie de comandă similare cu SAMtools.
Formatele de fișier acceptate în prezent sunt BAM, SAM, FASTQ, FASTA, QSEQ, BCF și VCF.
Pentru o descriere mai lungă la nivel înalt a Hadoop-BAM, consultați articolul „Hadoop-BAM: direct manipulating next generation sequencing data in the cloud” din Bioinformatics Vol. 28 Issue 6 pp. 876-877, disponibil online la: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts054
Rețineți că partea bibliotecă a Hadoop-BAM este destinată în principal dezvoltatorilor cu experiență în utilizarea Hadoop. Instrumentele din linia de comandă ale Hadoop-BAM ar trebui să fie ușor de înțeles pentru toți utilizatorii, dar sunt limitate în domeniul de aplicare.
Consultați proiectul SeqPig pentru o interfață de nivel superior la formatele de fișiere acceptate de Hadoop-BAM: http://seqpig.sourceforge.net
Consultați Seal pentru instrumentele de aliniere a citirii bazate pe Hadoop, Seal: http://biodoop-seal.sourceforge.net
Public
Dezvoltatorii
Limbaj de programare
Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
