Aceasta este aplicația Windows numită P3BSseq, care rulează în Windows online pe Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca P3BSseq_v2.1.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită P3BSseq pentru a rula în Windows online pe Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
SCREENSHOTS
Ad
P3BSseq să ruleze în Windows online peste Linux online
DESCRIERE
Procesarea secvențierii bisulfiților (BSseq) este printre cele mai greoaie aplicații de secvențiere de generație următoare (NGS). Deși sunt disponibile unele instrumente de procesare BSseq, acestea sunt împrăștiate, necesită parametri derutați și necesită timp de rulare și utilizare a memoriei. Am dezvoltat P3BSseq, o conductă de procesare paralelă pentru o analiză rapidă, precisă și automată a citirilor BSseq, care decupează, aliniază, adnotează, înregistrează rezultatele intermediare, efectuează evaluarea calității conversiei bisulfitului, generează metilom BED și raportează fișiere conform standardelor NIH. P3BSseq depășește mapperele BSseq cunoscute în ceea ce privește timpul de rulare și cerințele hardware ale computerului. Am optimizat parametrii P3BSseq atât pentru bibliotecile direcționale, cât și pentru cele nedirecționale, precum și pentru citirile cu un singur capăt și cele asociate ale genomului întreg și reprezentare redusă BSseq. P3BSseq este o soluție simplificată ușor de utilizat pentru analiza BSseq în amonte, care necesită doar cunoștințe de bază despre computer și NGS.DESCRIERE
- Procesarea datelor Next Generation Sequencing (NGS).
- Analiza metilomică ADN
- Procesare paralelă
- Reprezentare redusă a secvențierii bisulfiților (RRBS)
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Limbaj de programare
Piton
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
