Это команда bp_local_taxonomydb_queryp, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bp_local_taxonomydb_query - запрашивать в локальной базе данных TaxonomyDB виды или таксонид
ОПИСАНИЕ
Этот сценарий предоставляет пример реализации доступа к локальной базе данных таксономии.
реализовано с помощью Berkeley DB (необходим модуль DB_File).
Применение:
bp_local_taxonomydb_query.PLS: [-v] --nodes nodes.dmp --names names.dmp "Род1 разновидностей1" "Род2 разновидностей2"
Предоставление файлов nodes.dmp и names.dmp из дампа таксономии NCBI (см.
Bio :: DB :: Taxonomy :: flatfile для получения дополнительной информации) требуется только при первом запуске.
Это создаст локальные индексы и может занять довольно много времени. Однако однажды созданный,
эти индексы обеспечат быстрый доступ для видов к идентификатору таксона ИЛИ идентификатору таксона к названию вида
поиски.
Используйте bp_local_taxonomydb_queryp в Интернете с помощью сервисов onworks.net
