Это команда bp_mrtransp, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bp_mrtrans - реализовать преобразователь выравниваний из белков в координаты мРНК
СИНТАКСИС
Применение:
bp_mrtrans -i inputfile -o outputfile [-if формат ввода] [-of формат вывода] [-s cDNA
база данных последовательностей] [-sf формат последовательности кДНК] [-h]
ОПИСАНИЕ
Этот сценарий преобразует выравнивание белков обратно в кДНК. Свободно основанный на Билле
Mrtrans Пирсона.
Возможные варианты:
-o имя_файла - имя выходного файла [СТАНДАРТНЫЙ ВЫХОД по умолчанию]
-of format - формат выходной последовательности
(множественное выравнивание последовательностей)
[тип по умолчанию]
-i filename - входное имя файла [обязательно]
-if format - формат входной последовательности
(множественное выравнивание последовательностей)
[clustalw по умолчанию]
-s --seqdb filename - файл базы данных последовательностей кДНК
-sf --seqformat - формат базы данных seq кДНК (формат последовательности плоских файлов)
-h - это меню помощи
Используйте bp_mrtransp онлайн с помощью сервисов onworks.net
