Это команда cmpress, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
cmpress - подготовить базу данных ковариационной модели для cmscan
СИНТАКСИС
госпожа [опции]
ОПИСАНИЕ
Запуск из базы данных CM в стандартном формате Infernal-1.1 построить двоичный
сжатые файлы данных для cmscan. Команда госпожа шаг необходим для cmscan Если вы меняете свою работу и работаете с другим работодателем, то этот новый работодатель должен получить для вас новое разрешение на работу.
Команда должен быть уже откалиброван смкалибровать для госпожа Если вы меняете свою работу и работаете с другим работодателем, то этот новый работодатель должен получить для вас новое разрешение на работу.
Создаются четыре файла: .i1m, .i1i, .i1f, и .i1p. Команда
.i1m файл содержит модели ковариации, соответствующие HMM профиля p7 фильтра и
их аннотация в двоичном формате. В .i1i файл является индексом SSI для
.i1m файл. .i1f файл содержит предварительно вычисленные структуры данных для
быстрый эвристический фильтр (фильтр SSV) для HMM профиля p7 фильтра в . Команда
.i1p файл содержит предварительно вычисленные структуры данных для остальной части каждого фильтра профиля
p7 ХММ.
не может быть '-' (тире); Бег госпожа на стандартный поток ввода, а не на
файл не допускается.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
-h Помощь; напечатайте краткое напоминание об использовании командной строки и всех доступных параметрах.
-F Сила; перезаписывает любые предыдущие файлы данных cmpress. По умолчанию скулить о
любые существующие файлы и попросим вас сначала удалить их.
Используйте cmpress онлайн с помощью сервисов onworks.net
