Это команда cmtk-asegment_sri24, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
asegment_sri24 — Сегментация с использованием атласа SRI24
СИНТАКСИС
asegment_sri24 Целевое изображение
ОПИСАНИЕ
Зарегистрируйте целевое изображение в выбранном канале атласа человеческого мозга SRI24, затем
переформатируйте одну из карт меток атласа в целевое изображение. Примечание: предполагается, что
целевое изображение без черепа, т. е. содержит только мозг.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
Глобальный Инструментарий Возможности (эти общие by ВСЕ СМТК инструменты)
--Помогите
Записать список основных параметров командной строки в стандартный вывод.
--help-all
Записать полный список основных и расширенных параметров командной строки в стандартный вывод.
--вики
Записать список параметров командной строки в стандартный вывод в разметке MediaWiki.
--человек
Напишите исходный код страницы руководства в разметке nroff для стандартного вывода.
--xml
Запишите спецификацию синтаксиса командной строки в разметке XML (для интеграции с слайсером).
--версия
Напишите версию инструментария для стандартного вывода.
- эхо
Записать текущую командную строку в стандартный вывод.
--verbose-уровень
Установите уровень детализации.
--подробный, -v
Увеличить уровень детализации на 1 (не рекомендуется; поддерживается для обратной совместимости).
--потоки
Установите максимальное количество параллельных потоков (для потоков POSIX и OpenMP).
Главная Возможности
--быстро, -f
Быстрый режим.
--регистрационный-канал
Канал SRI24, используемый для регистрации целевого изображения. Поддерживаемые значения:
«spgr», «early-fse», «late-fse», «fa», где по умолчанию используется «spgr», или используйте один из
следующие:
--spgr
Структурный канал SPGR (T1-взвешенный) [Эта is дефолт]
--early-fse
Канал быстрого спинового эха с ранним эхо (PD-взвешенным)
--late-fse
Канал быстрого спинового эха позднего эха (T2-взвешенный)
--фа Канал фракционной анизотропии, полученный на основе изображений тензора диффузии
--label-map
Карта меток SRI24, переформатированная в целевое изображение. Поддерживаемые значения:
«tzo116plus», «lpba40», «ткань», где по умолчанию используется «tzo116plus», или используйте один из
следующие:
--tzo116plus
Расширенный шаблон кортикальной парцелляции на основе региона Tzourio-Mazoyer AAL 116.
шаблон. [Эта is дефолт]
--lpba40
Шаблон основан на сегментации вероятностного атласа мозга LONI по 40 субъектам.
--салфетка
SRI24 трехкомпонентная сегментация ткани с максимальной вероятностью (GM, WM, CSF)
карта.
АВТОРЫ
Торстен Рольфинг, при участии Майкла П. Хасака, Грега Джеффериса, Кэлвина Р.
Маурер, Даниэль Б. Русаков и Ярослав Гальченко
Используйте cmtk-asegment_sri24 онлайн с помощью сервисов onworks.net.
