Это команда cmtk-interleaved_bad_slices, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
interleaved_bad_slices - находит плохие срезы во временном ряду чередующихся изображений (например,
серия фМРТ в состоянии покоя).
СИНТАКСИС
interleaved_bad_slices пути к изображениям
ОПИСАНИЕ
Этот инструмент считывает временные ряды 3D-изображений и обнаруживает выбросы.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
Глобальный Инструментарий Возможности (эти общие by ВСЕ СМТК инструменты)
--Помогите
Записать список основных параметров командной строки в стандартный вывод.
--help-all
Записать полный список основных и расширенных параметров командной строки в стандартный вывод.
--вики
Записать список параметров командной строки в стандартный вывод в разметке MediaWiki.
--человек
Напишите исходный код страницы руководства в разметке nroff для стандартного вывода.
--версия
Напишите версию инструментария для стандартного вывода.
- эхо
Записать текущую командную строку в стандартный вывод.
--verbose-уровень
Установите уровень детализации.
--подробный, -v
Увеличить уровень детализации на 1 (не рекомендуется; поддерживается для обратной совместимости).
--потоки
Установите максимальное количество параллельных потоков (для потоков POSIX и OpenMP).
вход Возможности
--слайс-ориентация
Определите ориентацию среза диффузных изображений. Допустимые значения: «осевой»,
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", где по умолчанию "аксиальный",
или воспользуйтесь одним из следующих способов:
- осевой
Осевые срезы [Эта is дефолт]
- сагиттальный
Сагиттальные срезы
- корональный
Коронковые срезы
--slice-х
Ось координаты X - направление среза
--slice-у
Ось координаты Y - направление среза
--slice-z
Ось координаты Z - направление среза [Эта is дефолт]
Плохой Ломтик обнаружение
--метрический
Показатель сходства изображения с изображением для сравнения соседних срезов. Поддерживаемые значения:
«ncc», «rms», где значение по умолчанию - «ncc», или используйте одно из следующих значений:
--ncc
Нормализованная взаимная корреляция. [Эта is дефолт]
- среднеквадратичное значение
Корень среднеквадратичных разностей.
--stdev-thresh
Пороговое значение для идентификации плохих срезов в единицах стандартных отклонений интенсивности, превышающих
все соответствующие срезы из оставшихся диффузных изображений. [Дефолт: 3]
Результат Возможности
- плохие-ломтики-молотить
Минимальное количество обнаруженных плохих фрагментов перед сообщением об объеме (только количество
в этом случае сообщается об обнаруженных плохих срезах, а не о каждом срезе отдельно).
[Дефолт: 0]
АВТОРЫ
Торстен Рольфинг, при участии Майкла П. Хасака, Грега Джеффериса, Кэлвина Р.
Маурер, Даниэль Б. Русаков и Ярослав Гальченко
Используйте cmtk-interleaved_bad_slices в Интернете с помощью сервисов onworks.net