Это команда famap, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
famap - подготовить базу данных последовательностей Fasta для повторных поисков ПЦР
СИНТАКСИС
фамап [-hV] -b mmapped-файл [-t cvt] [файл ...]
фамап [-hV] -d mmapped-файл [ord ...]
фамап [-hV] -l mmapped-файл [ord ...]
ОПИСАНИЕ
Программа фамап является частью пакета e-PCR и используется для создания mmapped-файла из FASTA
файлы для обратного поиска электронной ПЦР
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
где cvt (таблица преобразования) является одним из:
выкл - как есть (по умолчанию)
n - допустимый нуклеотид [acgtnACGTN],
N - допустимый верхний регистр нуклеотидов [ACGTN]
nx - нуклеотид с допустимыми кодами неоднозначности
NX - нуклеотид с кодами неоднозначности в верхнем регистре
ПРИМЕР
famap -tN -b геном.famap org / chr _ *. fa
fahash -b genome.hash -w 12 -f3 $ {PWD} /genome.famap
повторная ПЦР -s genome.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTTT 120-200
Увидеть фамап(1) и повторно pcr(1)
Используйте famap онлайн с помощью сервисов onworks.net
