Это команда fastq-clipper, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
fastq-clipper - ea-utils: удаляет одну или несколько последовательностей адаптеров из файла fastq
ОПИСАНИЕ
использование: fastq-clipper [параметры]
Удаляет одну или несколько последовательностей адаптеров из файла fastq. Последовательности адаптера
разделенные двоеточием. Статистика отправляется в stderr, если только -o указан.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
-h Эта помощь
-o FIL Выходной файл (статистика в стандартный вывод)
-p N Максимальный процент разницы (10)
-m N Минимальная длина зажима (1)
-l N Минимальная оставшаяся длина последовательности (15)
-x [N] Дополнительная длина соответствия превышает длину адаптера,
N = -1: искать все N = 0: искать только до длины адаптера
-e Конец строки (по умолчанию)
-b Начало строки (пока не поддерживается)
Используйте fastq-clipper онлайн на сервисах onworks.net
