чеснок - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

чеснок - программа молекулярной визуализации

СИНТАКСИС

чеснок [правда Чеснок кредита] [X11 кредита] [имя файла]

ОПИСАНИЕ

Эта страница руководства кратко документирует чеснок, бесплатная программа молекулярной визуализации.
Обширную документацию в формате HTML и исходные коды можно найти дома для отпуска,
<URL:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. Физическое местонахождение: Медицинский факультет Университета.
Осиека, Хорватия, Европы. Предварительно скомпилированные пакеты для ряда дистрибутивов GNU / Linux
доступны. К ним относятся Debian, SuSE, Mandriva, Linspire и ряд других
дистрибутивы. Документацию в формате HTML можно загрузить и распаковать для локального использования (рекомендуется
использование). Здесь вы можете найти очень краткое описание программы и список команд
параметры линии.

чеснок это программа молекулярной визуализации, изначально написанная для исследования
мембранные белки. Теперь его можно использовать для визуализации и простого редактирования всех белков и
молекулы. Эта версия распознает формат PDB версии 2.1; посмотреть исходный файл pdb_atom.c
для получения подробной информации об этом формате.

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ

Параметры командной строки можно разделить на две группы: правда (специфический) чеснок кредита и X11
кредита. Опции могут быть указаны в любом порядке. Все параметры и жестко заданные значения по умолчанию
перечислены в таблице ниже. Для каждого параметра значение, определенное в командной строке, равно
б / у, если есть. В противном случае значение, определенное в .garlicrc файл используется. Если .garlicrc
файл недоступен, или в этом файле нет соответствующей записи, жестко запрограммированный
используется значение по умолчанию. Пример .garlicrc файл, входящий в исходный пакет, содержит
значения равны жестко заданным значениям по умолчанию.

чеснок опции:
-час, --Помогите
Распечатать справку и выйти.

-в, --версия
Версия для печати и выход.

-р, --регистр
Зарегистрируйте чеснок: сообщите автору, что на вашем сайте установлен чеснок и что кто-то
собирается использовать эту программу. Регистрируясь, вы поощряете автора
продолжить развитие чеснока. Вы также можете помочь автору обеспечить поддержку
Дальнейшее развитие. Эта опция отправляет одно короткое сообщение электронной почты, содержащее только
заголовок сообщения электронной почты и слово «Привет!», чтобы[электронная почта защищена]>. Пожалуйста
выполните чеснок -r, если собираетесь использовать эту программу. Если вы не подключены к
в Интернете рассмотрите возможность отправки короткого сообщения из какой-либо другой системы.

-носис Скройте значок системы координат (верхний левый угол).

-нет управления
Скройте окно управления (верхний правый угол).

-стерео
Отображение стереоизображения.

-плитка Режим
Режим плиты по умолчанию. Доступные режимы перекрытия: выкл., Планарный (по умолчанию), сфера,
полусфера, цилиндр и полуцилиндр.

выцветание Режим
Режим затухания цвета по умолчанию. Доступные режимы: выкл., Планарный (по умолчанию), сфера,
полусфера, цилиндр и полуцилиндр.

-как номер
Стиль рисования атомов по умолчанию (жестко заданное значение по умолчанию: 2).

-бс номер
Стиль рисования облигаций по умолчанию (жестко заданное значение по умолчанию: 2).

-фс номер
Количество поверхностей с выцветанием по умолчанию. Параллельные плоскости, концентрические сферы или
концентрические цилиндры могут использоваться в качестве затухающих поверхностей. Три триплета RGB
присваивается каждой поверхности. Поверхности расположены равномерно; минимум один и максимум
восемь должны быть определены. По крайней мере три цвета (левый, средний и правый)
присваивается каждому видимому атому. Эти три цвета основаны на положении
данного атома относительно ближайшей затухающей поверхности (ей) и от цветов, назначенных
эти поверхности. Цвета комбинируются с использованием линейного взвешивания.

-lc цвет
Левый цвет на i-й поверхности; i находится между нулем и семью. Цветовая строка
должен соответствовать X11R5. Синий, например, может быть определен как синий или как
RGB: 0000/0000 / FFFF и т. Д. Например, -lc4 RGB: BBBB / 8888/4444 определяет левый цвет.
на поверхности, индекс которой равен четырем.

-mc цвет
Средний цвет на i-й поверхности.

-rc цвет
Правильный цвет на i-й поверхности.

-ПК, --print-config
Распечатать данные конфигурации и выйти.

-pcn Вывести имена курсоров на стандартный вывод и выйти.

-журнал журнальный файл
Записывать команды и сообщения в файл журнала. Файл будет создан в текущем
рабочий каталог. Если это невозможно, файл журнала будет создан на домашней странице пользователя.
каталог.

X11 опции:
-дисплей показать имя
X-сервер для связи.

-геометрия геом
Геометрия окна (по умолчанию: почти весь экран).

-бг цвет
Цвет фона главного окна (по умолчанию черный).

-фг цвет
Цвет переднего плана главного окна (по умолчанию: белый).

-фн название шрифта
Шрифт текста; (по умолчанию 10x20).

-тбг цвет
Цвет фона текста (по умолчанию черный).

-тфг цвет
Цвет текста (по умолчанию белый).

-курсор имя_курсора
Название курсора; видеть /usr/include/X11/cursorfont.h для имен; удалите префикс XC_.

Используйте чеснок онлайн на сервисах onworks.net