Это команда garniere, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
garnier - Прогнозирует вторичную структуру белка с использованием метода газового фактора.
СИНТАКСИС
Garnier -последовательность Seqall -idc целое -выходной файл докладе
Garnier -Помощь
ОПИСАНИЕ
Garnier это программа командной строки от EMBOSS («European Molecular Biology Open
Программный пакет »). Он является частью группы (групп) команд «Белок: 2D-структура».
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
вход .
-последовательность Seqall
Фильтр .
-idc целое
В своей статье GOR упоминает, что если вы что-то знаете о вторичной структуре
содержание белка, который вы анализируете, вы можете лучше прогнозировать. 'idc' - это
index в набор массивов, dharr [] и dsarr [], которые предоставляют «константы решения»
(dch, dcs), которые представляют собой смещения, применяемые к весам для спирали и листа
(продлить) сроки. Итак, idc = 0 говорит, что не использовать смещения констант решения, а idc = от 1 до 6
указывает, что следует использовать различные комбинации смещений dch, dcs.
Результат .
-выходной файл докладе
Используйте garniere онлайн с помощью сервисов onworks.net
