Это команда gt-bed_to_gff3, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
gt-bed_to_gff3 - Разобрать файл BED и преобразовать его в GFF3.
СИНТАКСИС
gt кровать_to_gff3 [BED_файл]
ОПИСАНИЕ
-тип объекта [string]
Установить тип анализируемых функций BED (по умолчанию: BED_feature)
-толстый шрифт [string]
Установить тип проанализированных толстых элементов BED (по умолчанию: BED_thick_feature)
-тип блока [string]
Установить тип анализируемых блоков BED (по умолчанию: BED_block)
-o [имя файла]
перенаправить вывод в указанный файл (по умолчанию: undefined)
-gzip [да | нет]
записать сжатый выходной файл gzip (по умолчанию: нет)
-bzip2 [да | нет]
записать сжатый выходной файл bzip2 (по умолчанию: нет)
-сила [да | нет]
принудительная запись в выходной файл (по умолчанию: нет)
-Помощь
отобразить справку и выйти
-версия
отобразить информацию о версии и выйти
СОСТАВЛЕНИЕ ОТЧЕТОВ ОШИБКИ
Сообщайте об ошибках[электронная почта защищена]>.
Используйте gt-bed_to_gff3 онлайн с помощью сервисов onworks.net
