Это команда libscanoute, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
libscanout - читает файл DHF и записывает в него самые популярные классы, складки и
Надсемейства.
СИНТАКСИС
libscanout -dhfinfile вводить -выходной файл Outfile
libscanout -Помощь
ОПИСАНИЕ
libscanout это программа командной строки от EMBOSS («European Molecular Biology Open
Программный пакет »). Он является частью группы (групп) команд «Белок: 3D-структура».
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
вход .
-dhfinfile вводить
Этот параметр указывает расположение файла DHF (файл совпадений домена) (ввод). А
'файл совпадений домена' содержит совпадения (последовательности) базы данных с классификацией домена
информация в форматах FASTA или EMBL. Хиты являются родственниками семьи SCOP или CATH.
и находятся при поиске в базе данных последовательностей. Файлы, содержащие обращения, полученные от
PSIBLAST генерируются с помощью SEQSEARCH.
необходимые .
Результат .
-выходной файл Outfile
Этот параметр указывает расположение файла сводки (вывода). Сводный файл
содержит списки классов доменов, суперсемейств и семейств, упорядоченные по рангу на основе
оценки (сначала набравшие наибольшее количество очков).
Используйте libscanoute онлайн с помощью сервисов onworks.net
