Это команда mbfa-mpi, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
mbfa - Конвертер двоичных форматов Murasaki FASTA
СИНТАКСИС
mbfa [параметры ...] [вход] [вход2 ...] # преобразовать [вход] и [вход2 ...] в файлы Muraaski Binary FASTA
ОПИСАНИЕ
Мурасаки обрабатывает данные последовательности, используя 2-битный формат, где каждая база представлена с использованием
2 бита. Есть ряд уже существующих форматов, которые делают похожие вещи, но в
В частности, Мурасаки нужно знать о метаданных, которые нельзя выразить всего за 2
биты (например, если есть последовательности NNNN, последовательность разрывается, когда несколько последовательностей
включены в файл FASTA и т. д.), поэтому формат MBFA также включает эти данные.
Обычно эти файлы создаются Мурасаки автоматически при первом запуске на новом компьютере.
последовательность.
Поскольку формат файла разработан близко к Murasaki, фактическое расширение файла
будет отличаться в зависимости от вашей архитектуры. Обычно это будет некоторая форма .mbfa [48] [48]
(например, ".mbfa88" (сборка gcc по умолчанию на amd64)).
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
--info | -i
Показать метаданные о каждом указанном MBFA.
--force | -f
По умолчанию МБФА пропустит файлы, в которых уже есть недавние файлы .mbfa. Этот вариант
форсирует регенерацию этих файлов.
--смертельный | -F
Делает ошибки фатальными. Обычно, если вы указываете несколько файлов, mbfa попытается преобразовать
все из них, даже если один не выдаст предупреждение. С --fatal он остановится и выйдет
с ошибкой, если есть проблема.
--fasta | -A
Генерирует вывод FASTA, соответствующий стандартному выводу на основе данных MBFA.
--help | -h, --version | -V, --verbose | -V
Чего и следовало ожидать.
Используйте mbfa-mpi в Интернете с помощью сервисов onworks.net
