Это командный обротамер, который можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
обротамер - генерировать координаты конформера / ротамера
СИНТАКСИС
обротамер имя файла
ОПИСАНИЕ
Инструмент обротамера можно использовать как часть конформационного поиска путем генерации случайных
изомеры на основе вращающихся двугранных углов. Эти ротамеры не являются конформерами, то есть
obrotamer не выполняет оптимизацию геометрии после создания структуры ротамера. В
Инструмент obminimize может выполнять оптимизацию геометрии с использованием молекулярной механики.
ПРИМЕРЫ
обротамер baseconformer.sdf> rotamer1.sdf
Сгенерируйте случайный вращающийся изомер baseconformer.sdf и запишите его в rotamer1.sdf
Используйте обротамер онлайн с помощью сервисов onworks.net
