Это команда pepnete, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
pepnet - Нарисуйте спиральную сеть для белковой последовательности
СИНТАКСИС
пепнет -последовательность последовательность -амфипатический тумблер -квадраты string -бриллианты string
-октаги string -граф график
пепнет -Помощь
ОПИСАНИЕ
пепнет это программа командной строки от EMBOSS («European Molecular Biology Open
Программный пакет »). Он является частью группы (групп) команд «Display, Protein: 2D Structure».
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
вход .
-последовательность последовательность
Результат .
-амфипатический тумблер
Если это так, то остатки ACFGILMVWY помечаются квадратами, а все остальные
остатки немаркированные. Это отменяет любую другую разметку, которую вы могли указать
с использованием квалификаторов -squares, -diamonds и -octags.
-квадраты string
По умолчанию алифатические остатки ILVM отмечены квадратами. Значение по умолчанию: ILVM
-бриллианты string
По умолчанию остатки DENQST отмечены ромбами. Значение по умолчанию: DENQST.
-октаги string
По умолчанию положительно заряженные остатки HKR помечены восьмиугольниками. Дефолт
стоимость: HKR
-граф график
Используйте pepnete онлайн с помощью сервисов onworks.net