pymvpa2-dump - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

pymvpa2-dump - экспорт компонентов набора данных в другие (файловые) форматы

СИНТАКСИС

pymvpa2 дамп [--версия] [-h] -i НАБОР ДАННЫХ [НАБОР ДАННЫХ ...] [-s | --са SA | --фа FA | --да DA]
[-o ВЫВОД] [-f {hdf5, nifti, npy, txt}] [--mapper-набор данных НАБОР ДАННЫХ [НАБОР ДАННЫХ ...]]
[--hdf5-сжатие ТИП]

ОПИСАНИЕ

Дамп компонентов набора данных в различных форматах

Один компонент произвольного набора данных (образец данных, образец атрибута, атрибут объекта,
атрибут набора данных) можно выбрать и экспортировать в другой формат. Список поддерживаемых
форматы и их соответствующие возможности приведены ниже.

ОБЫЧНЫЙ ТЕКСТ ВЫХОД

1D и 2D числовые данные можно экспортировать как обычный текст. Кроме того, списки строк
также поддерживается. Обычно данные экспортируются с одним элементом в строке, за исключением 2D.
числовые матрицы, в которых вся строка записывается в одну строку (через пробел).

Для всех неподдерживаемых данных выдается предупреждение и усеченное текстовое описание
дан компонент набора данных.

ХРАНЕНИЕ HDF5

Произвольные данные (типы) могут храниться в контейнерах HDF5. Для простых данных, которые изначально
при поддержке HDF5 создается набор данных HDF5 верхнего уровня, содержащий все данные. Сложный, а не
изначально поддерживаемые типы данных сериализуются перед сохранением в HDF5.

БИНАРНЫЕ ФАЙЛЫ NUMPY NPY

Этот формат данных предназначен для хранения числовых данных (с произвольным числом измерений в
двоичный формат).

НИФТИ ФАЙЛЫ

Этот формат данных предназначен для (многомерных) пространственных изображений. Входные наборы данных должны иметь
mapper, который может обратно отображать соответствующий компонент набора данных обратно в пространство изображения.

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ

--версия
показать версию программы и информацию о лицензии и выйти

-h, --Помогите, --help-np
показать это справочное сообщение и выйти. --help-np принудительно отключает использование пейджера
для отображения справки.

-i НАБОР ДАННЫХ [НАБОР ДАННЫХ ...], --Вход НАБОР ДАННЫХ [НАБОР ДАННЫХ ...]
пути к одному или нескольким файлам набора данных PyMVPA. Все наборы данных будут объединены в
единый набор данных (сложенный) в порядке спецификации. В некоторых случаях эта опция может
необходимо указывать более одного раза, если несколько, но отдельные входные наборы данных
требуется.

-o ВЫХОД, --выход ВЫВОД
имя выходного файла. Если имя выходного файла не указано, вывод будет направлен на стандартный вывод,
если разрешено форматом данных

-f {hdf5, nifti, npy, txt}, --формат {hdf5, nifti, npy, txt}
Выходной формат

--mapper-набор данных НАБОР ДАННЫХ [НАБОР ДАННЫХ ...]
путь к набору данных PyMVPA, сопоставитель которого должен использоваться для функций обратного сопоставления
в объемное пространство для экспорта НИФТИ. По умолчанию картограф во входном наборе данных
используется.

Возможности для выбор Набор данных компоненты:
-s, - образцы
дамп образцов набора данных.

--са SA
имя образца атрибута, который нужно выгрузить.

--фа FA
имя сбрасываемого атрибута объекта.

--да DA
имя выгружаемого атрибута набора данных.

Опция для HDF5 вывод:
--hdf5-сжатие ТИП
тип сжатия для хранения HDF5. Доступные значения зависят от конкретного HDF5.
установка. Типичные значения: gzip, lzf, szip или целые числа от 1 до 9.
с указанием уровней сжатия gzip.

ПРИМЕРЫ

Распечатайте образец атрибута

$ pymvpa2 дамп -i mydata.hdf5 --sa subj

Экспортируйте образец массива данных в формат NumPy .npy.

$ pymvpa2 дамп -i mydata.hdf5 -s -f npy -d mysamples.npy

Используйте pymvpa2-dump онлайн через сервисы onworks.net