Это команда vcf-phased-join, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
vcf-phased-join - взять несколько перекрывающихся предварительно фазированных фрагментов и объединить их в
один VCF
СИНТАКСИС
vcf-поэтапное соединение [ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ] A.vcf Б.вкф C.vcf
ОПИСАНИЕ
О программе: сценарий берет несколько перекрывающихся предварительно подготовленных фрагментов и объединяет их в
один VCF
использование гетерозиготных сигналов от перекрытий для определения правильной фазы.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
-j, --min-соединить-качество
Порог качества для склейки предварительно фазированных блоков [10]
-l, --список
Список VCF, к которым нужно присоединиться.
-o, --выход
Имя выходного файла. Если указан "-", будут использоваться STDOUT и STDERR.
-q, --мин-PQ
Разрыв предварительно фазированных сегментов, если значение PQ ниже во входных VCF [0.6]
-h, - ?, --Помогите
Это справочное сообщение
Используйте vcf-phased-join онлайн с помощью сервисов onworks.net