Это приложение для Linux под названием Genome Micros satellite Analyzing Tool, последний выпуск которого можно загрузить как gmatoV1.2Build20130106.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Genome Micros Satellite Analyzing Tool с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Инструмент для анализа генома микросателлитов
ОПИСАНИЕ
Увеличивающаяся доступность последовательностей все более и более огромных полных геномов (> 1G) победила существующие в настоящее время инструменты анализа SSR. Инструмент для анализа микросателлитов в масштабе всего генома (GMATo) - это новая мощная программа для более быстрого анализа SSR любой длины, любого размера и комплексного статистического анализа в геномном аспекте, специально разработанная для огромного генома на основе скриптов Perl. Требуется только один входной файл, который содержит последовательности ДНК в необработанном формате fasta, а выходные файлы в табличном формате содержат всю информацию о локусах SSR и статистическое распределение по четырем интересующим биологам классификациям. GMATo также имеет простой графический пользовательский интерфейс, написанный на Java, и интерфейс командной строки на Perl, работающий на платформах Windows, Linux, Mac и т. Д., С легко настраиваемым контролем параметров для биологов и биоинформатиков. Программное обеспечение GMATo - лучший инструмент для характеристики SSR в огромном геномецитируйте эту статью: Wang X. et al, Bioinformation [2013, 9 (10): 541-544]
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/gmato/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.