Это приложение для Linux под названием 123VCF, последнюю версию которого можно загрузить как 123VCF_binary.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием 123VCF с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
123ВКФ
ОПИСАНИЕ
123VCF был разработан, чтобы сделать этап фильтрации файлов VCF более надежным и эффективным.
Его можно использовать на наиболее важном этапе секвенирования всего экзома и анализа данных секвенирования всего генома в исследованиях, а также в клинических условиях.
Он просто получает файл порядка фильтрации и файл вариантов, а затем фильтрует варианты на основе того, что вы заказали в файле порядка фильтрации.
Руководство пользователя:
https://dl.adbioinformatics.net/123VCF/123VCF_Manual.ver1.pdf
_____________________________________
Авторы: Милад Эйди, Саманэ Абдолализаде, Сохейла Моейни
Научные руководители: Джавад Захири, доктор философии - Масуд Гаршасби, доктор философии
Особенности
- Графический интерфейс пользователя
- Легко использовать
- Легко понять
- Сжатые или несжатые файлы VCF в качестве входных данных
- Сохранившиеся варианты представлены в формате VCF, формате, разделенном табуляцией.
- 123VCF помещает одни и те же варианты функций BED, когда пользователь определяет фильтр BED рядом друг с другом в файле TSV для обнаружения возможных составных гетерозиготных вариантов.
Аудитория
Образование, продвинутые конечные пользователи, конечные пользователи / настольные компьютеры, тестировщики
Интерфейс пользователя
Java-свинг
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/project123vcf/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
