Это приложение для Linux под названием AmPEP и AxPEP, последний выпуск которого можно загрузить как deep-ampep30-test_set.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием AmPEP и AxPEP с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
AmPEP и AxPEP
ОПИСАНИЕ
Антимикробные пептиды (AMP) являются многообещающими кандидатами в борьбе с патогенами с множественной лекарственной устойчивостью из-за их широкого диапазона действий и низкой токсичности. Однако идентификация AMP с помощью влажных лабораторных экспериментов по-прежнему требует больших затрат времени и средств. AmPEP - это точный вычислительный метод для прогнозирования AMP с использованием алгоритма случайного леса. Модель прогнозирования основана на закономерностях распределения свойств аминокислот по последовательности. Наша оптимальная модель, AmPEP с соотношением данных 1: 3, достигла очень высокой точности 96%, MCC 0.9, AUC-ROC 0.99 и статистики Каппа 0.9. AmPEP превосходит существующие методы в отношении точности, MCC и AUC-ROC при тестировании с использованием эталонных наборов данных.Особенности
- Исходный код MATLAB
- Наборы данных AmPEP
- Машинное обучение
- Биоинформатика
- Пептидная последовательность
- Открытие лекарств
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/axpep/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
