Это приложение для Linux под названием BiomeNet для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как BiomeNet.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием BiomeNet, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
BiomeNet для запуска в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
Метагеномика дает огромное количество микробных последовательностей, которым можно приписать метаболическую функцию. Использование таких данных для вывода метаболической дивергенции на уровне сообщества затруднено из-за отсутствия подходящей статистической основы. Здесь мы описываем новую иерархическую байесовскую модель, называемую BiomeNet (байесовский вывод метаболических сетей), для вывода дифференциальной распространенности метаболических сетей среди микробных сообществ. Чтобы сделать вывод о структуре метаболических взаимодействий на уровне сообщества, BiomeNet применяет структуру моделирования смешанного членства к информации о содержании ферментов. Основная идея состоит в том, что компоненты смеси модели (метаболические реакции, подсети и сети) являются общими для всех групп (образцы микробиома), но пропорции смеси варьируются от группы к группе. С помощью этой структуры модель может фиксировать вложенные структуры в данных. BiomeNet уникален тем, что моделирует каждый образец метагенома как смесь сложных метаболических систем (метабосистем).Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C ++, S / R
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/biomenet/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.