Это приложение для Linux с именем come, последний выпуск которого можно загрузить как come-0.0.1.jar. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите в Интернете это приложение с названием "Поставляется с OnWorks" бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
пришел
Ad
ОПИСАНИЕ
Доступность хроматина играет ключевую роль в эпигенетической регуляции активации и молчания генов. Открытые области хроматина позволяют регуляторным элементам, таким как факторы транскрипции и полимеразы, связываться для экспрессии генов, в то время как закрытые области хроматина предотвращают активность транскрипционного аппарата. Недавно были разработаны методы определения занятости нуклеосом и метиломного секвенирования (NOMe-seq) для одновременного профилирования доступности хроматина и метилирования ДНК на отдельных молекулах. Однако не существует вычислительного метода для анализа данных NOMe-seq.
Результаты: в этой статье мы представляем CAME, подход, основанный на расширении семян, который определяет доступность хроматина из NOMe-seq. Эффективность и действенность CAME была продемонстрирована путем сравнения с другими существующими методами как на смоделированных, так и на реальных данных, и результаты показывают, что наш метод не только может точно определить доступность хроматина, но и превосходит другие методы.
Аудитория
Конечные пользователи / рабочий стол
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/came/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
