Это приложение для Linux под названием CpDB, последний выпуск которого можно загрузить как CpDB.20150623.static.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CpDB с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
CpDB
Ad
ОПИСАНИЕ
Это программное обеспечение позволяет нам создавать реляционную базу данных в Postgres для размещения полных бактериальных геномов. Помимо базы данных, также существуют программные инструменты, такие как парсер, для преобразования файлов EMBL или GBK в реляционную схему CpDB. Попав в CpDB, можно извлекать неограниченное количество отчетов из бактериального генома с помощью SQL. Это программное обеспечение является частью программы Ph.D. в области биоинформатики от Андерсона Сантоса и был разработан в рамках проекта пангенома Corynebacterium pseudotuberculosis (Cp). Пангеном Cp предоставил научному сообществу 15 штаммов бактерий, депонированных в базе данных GenBank в период с 2009 по 2012 годы. Полный текст диссертации был написан на португальском языке. Глава книги, объясняющая на английском языке, почему и для чего это программное обеспечение, доступна по адресу: http://www.intechopen.com/articles/show/title/whole-genome-annotation-in-silico-analysis. CpDB также был основой инструмента Pannotator: http://pannotator.facom.ufu.br
Наслаждайся этим.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C, PL / SQL
Среда базы данных
PostgreSQL (pgsql)
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/cpdb/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
