Это приложение для Linux под названием CSBB-v3.0, последний выпуск которого можно загрузить как CSBB-v3.0.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CSBB-v3.0 с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
CSBB-v3.0
Ad
ОПИСАНИЕ
CSBB - это пакет биоинформатики на основе командной строки для анализа биологических данных, полученных в ходе различных биологических экспериментов. CSBB реализован на Perl, в то время как он также использует использование R, java, python и ruby в фоновом режиме для определенных модулей. Основное внимание CSBB уделяет тому, чтобы позволить пользователям из биологических и биоинформатических сообществ получать выгоду от выполнения задач последующего анализа, устраняя при этом необходимость писать программный код. CSBB в настоящее время доступен для Linux, UNIX.В настоящее время CSBB предоставляет 18 модулей, ориентированных на аналитические задачи, такие как выполнение нормализации верхнего квантиля, интерактивная визуализация и конвейеры секвенирования следующего поколения. CSBB теперь также имеет возможность обрабатывать общедоступные данные. Предоставление пользователю опыта сквозного конвейера.
Особенности
- Секвенирование РНК
- ЧИП-Seq
- ATAC-Seq
- Нормализация
- Дифференциальное выражение
- Обработка общедоступных данных
- Сквозные трубопроводы
- Open Source
- Визуализация
- Биоинформатика
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Perl
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/csbb-v3-0/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
