Это приложение для Linux под названием FamSeq для онлайн-запуска в Linux, последний выпуск которого можно загрузить как FamSeq1.0.2.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием FamSeq, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
FamSeq для запуска в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
Редкими вариантами назвать пока сложно. В семейных исследованиях секвенирования следует использовать информацию от всех членов семьи для более точного определения новых мутаций зародышевой линии. FamSeq служит этой цели, обеспечивая вероятность того, что у человека есть вариант, с учетом исходных измерений всей его / ее семьи. FamSeq учитывает мутации de novo и может выполнять вызов вариантов на хромосоме X.Чтобы учесть различия в сложности данных, FamSeq состоит из трех различных реализаций Менделирующей генетической модели: алгоритма байесовской сети, алгоритма Элстона-Стюарта и алгоритма Монте-Карло цепи Маркова. Чтобы сделать программное обеспечение эффективным и применимым к большим семьям, мы распараллелили алгоритм байесовской сети, который справляется с родословными с циклами инбридинга без потери точности вычислений на графическом процессоре NVIDIA®.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C + +
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/famseq/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
