Это приложение для Linux под названием FastQC, последнюю версию которого можно загрузить как v0.12.1sourcecode.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием FastQC с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Быстрый контроль качества
ОПИСАНИЕ
FastQC — это инструмент анализа контроля качества, предназначенный для выявления потенциальных проблем в наборах данных высокопроизводительного секвенирования. Его цель — предоставить простой способ проверки качества необработанных данных секвенирования, поступающих из конвейеров секвенирования с высокой пропускной способностью. Это достигается путем запуска модульного набора анализов одного или нескольких необработанных файлов последовательностей в формате fastq или bam. Затем он создает отчет, в котором суммируются результаты и выделяются любые области, в которых библиотека может показаться необычной. Затем это должно направить вас туда, где ваши данные могут иметь проблемы, и позволить вам предпринять необходимые шаги для их исправления, прежде чем приступать к дальнейшему анализу.
FastQC не привязан к какому-либо конкретному методу секвенирования, поэтому его можно использовать для просмотра библиотек различных типов экспериментов (геномное секвенирование, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq и т. д. и т. д.).
Особенности
- Импорт данных из файлов BAM, SAM или FastQ
- Предлагает краткий обзор, который выделяет потенциальные проблемные области
- Сводные графики и таблицы для быстрой оценки данных
- Экспорт результатов в HTML
- Можно использовать в автономном режиме
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
