Это приложение для Linux под названием GENIE (GEne-geNe IntEraction) для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как GENIE_src.tar. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием GENIE (GEne-geNe IntEraction), чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
GENIE (GEne-geNe IntEraction) для работы в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
Взаимодействие ген-ген в исследованиях генетических ассоциаций требует больших вычислительных ресурсов, когда задействовано большое количество SNP. Большинство новейших центральных процессоров (ЦП) имеют несколько ядер, тогда как графические процессоры (ГП) также имеют сотни ядер и недавно использовались для реализации более быстрого научного программного обеспечения. Однако в настоящее время нет пакетов программного обеспечения для генетического анализа, которые позволяют пользователям полностью использовать вычислительную мощность этих многоядерных устройств для анализа генетического взаимодействия для бинарных признаков.Здесь мы представляем новый программный пакет GENIE, который использует мощность нескольких процессорных ядер GPU или CPU для распараллеливания анализа взаимодействия.
Образец цитирования: Chikkagoudar, S., Wang, K., & Li, M. (2011). GENIE: программный пакет для анализа взаимодействия генов в исследованиях генетических ассоциаций с использованием нескольких ядер GPU или CPU. Примечания к исследованию BMC, 4 (1), 158.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/gpugenie/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
