Это приложение для Linux под названием Hamstr, последний выпуск которого можно загрузить как hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение Hamstr с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Хамстр
Ad
ОПИСАНИЕ
HaMStR переехал в https://github.com/bionf/hamstr где он теперь является частью пакета HaMStR-OneSeq.
HaMStR - это инструмент на основе марковской модели со скрытым профилем для направленного поиска ортологов в EST или данных последовательности белков. Программа принимает в качестве входных данных заранее заданную основную группу ортологичных последовательностей (основные ортологи) и набор последовательностей из таксона поиска. Затем HaMStR объединяет в двухэтапной стратегии поиск на основе pHMM и обратный поиск с помощью BLAST для расширения основной группы ортологов новыми последовательностями из поискового таксона.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Perl
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/hamstr/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.