Это приложение для Linux под названием MarDRe для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как MarDRe-v1.4.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MarDRe, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
MarDRe для запуска в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
MarDRe - это de novo параллельный инструмент на основе MapReduce для удаления повторяющихся и почти повторяющихся считываний ДНК посредством кластеризации одно- и парно-конечных последовательностей из наборов данных FASTQ / FASTA. Этот инструмент позволяет биоинформатике избегать анализа ненужных считываний, сокращая время последующих процедур с набором данных.MarDRe - это аналог ParDRe для больших данных (ссылка выше), который использует технологии HPC (т. Е. Гибридный MPI / многопоточность) для сокращения времени выполнения в многоядерных системах. Вместо этого MarDRe использует модель программирования MapReduce для значительного повышения производительности ParDRe в распределенных системах, особенно в облачных инфраструктурах. Написанный на чистой Java для максимальной кроссплатформенной совместимости, MarDRe основан на проекте Apache Hadoop с открытым исходным кодом, наиболее популярной среде распределенных вычислений для обработки больших данных.
Аудитория
Информационные технологии, здравоохранение, наука / исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал, Командная строка
Язык программирования
Java
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/mardre/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
