Это приложение Linux под названием metasort для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как metaSort.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием metasort, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
метасорт для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Большинство современных подходов анализируют метагеномные данные с участием эталонных геномов. Однако новые микробные сообщества выходят далеко за рамки справочных баз данных, и сборка метагенома de novo из сложных микробных сообществ по-прежнему остается большой проблемой. Здесь мы представляем новую экспериментальную и биоинформатическую основу, metaSort, для эффективного построения бактериальных геномов из метагеномных образцов. MetaSort обеспечивает подход отсортированного мини-метагенома, основанный на методологиях проточной цитометрии и одноклеточного секвенирования, и использует новые вычислительные алгоритмы для эффективного восстановления высококачественных геномов из отсортированного мини-метагенома путем дополнения исходного метагенома. Путем обширных оценок смоделированных наборов данных, микробиомов слюны и кишечника мы продемонстрировали, что metaSort обладает превосходной и беспристрастной производительностью при восстановлении и сборке генома.Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/metasort/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
