Это приложение для Linux под названием NeedlemanWunsch, последнюю версию которого можно загрузить как Needleman_wunsch-0.3.5.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием NeedlemanWunsch с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
НидлманВунш
ОПИСАНИЕ
ПЕРЕМЕЩЕНА В GITHUB: https://github.com/noporpoise/seq-align
Глобальное оптимальное выравнивание последовательностей с использованием алгоритма Нидлмана-Вунша.
Выравнивает ДНК, РНК, последовательность белков и многое другое!
Посмотрите наш сестринский проект местного выравнивания с использованием Smith-Waterman:
http://sourceforge.net/projects/smithwaterman/
Особенности
- Штрафы за аффинный пробел
- Можно не устанавливать штраф за пробелы для пробелов в начале и конце выравнивания.
- Цветной выход
- Читает файлы FASTA, FASTQ и простые последовательности (включая файлы, заархивированные с помощью gzip)
- Предустановленные матрицы замещения ДНК / белков (PAM / BLOSUM и т. Д.)
- Может загружать матрицы штрафов за замену
- Переносимый код C, который можно использовать в других проектах биоинформатики
Аудитория
Наука / Исследования, Образование
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал, Командная строка
Язык программирования
C ++, C
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
