Это приложение для Linux под названием PARSEC — PAtteRn SEarch/Context, последнюю версию которого можно загрузить как PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием PARSEC - PAtteRn SEarch / Context with OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
PARSEC — ПОИСК ПО ОБРАЗЦУ / КОНТЕКСТ
ОПИСАНИЕ
Характеристика геномных сайтов - серьезная проблема в понимании и использовании данных секвенирования следующего поколения. Большинство геномных сайтов представлены короткими вырожденными мотивами с разбросанным распределением, а иногда и с биологической функцией (например, регуляция экспрессии генов, паттерны сплайсинга или эпигенетические сигналы). Эти мотивы связаны с огромным количеством шума, и поэтому разработка вычислительной платформы для точного обнаружения геномных сайтов требует интеграции различных крупномасштабных биологических данных, чтобы отфильтровать ложные срабатывания.
PARSEC представляет собой интуитивно понятное, модульное (легко расширяемое) и универсальное решение для эффективной интеграции большого количества разнообразной геномной информации с целью выполнения нелинейной локализации и характеристики биологических сайтов в удобной для пользователя среде.
Требования к оборудованию и поддерживаемые браузеры см. В вики.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Веб-
Язык программирования
C ++, Java
Среда базы данных
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
