Это приложение для Linux под названием PINCIS, последнюю версию которого можно загрузить как PINCIS_v12.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием PINCIS с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
ПИНЧИС
ОПИСАНИЕ
PINCIS.pl (скрипт PIcs N-/C-terminal Inferred Substrates perl) представляет собой небольшой инструмент командной строки для обозначения и анализа данных PICS (Schilling et al., Nat. Protocols, 2011) для получения основного и неосновного сайта. специфичность протеаз. Таким образом, скрипт фильтрует заданные списки пептидов для библиотечных пептидов (сгенерированных протеазой расщепления в рабочем процессе протеомики, а не интересующей протеазой) и распечатывает списки предполагаемых расширений окон N- и C-конца расщепления, которые можно одновременно использовать для создания визуализации специфичности расщепления, такие как iceLogo (https://iomics.ugent.be/icelogoserver/create).
Особенности
- Анализ данных PICS
- Определение окна расщепления
Аудитория
Другая аудитория
Язык программирования
Perl
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/pincis/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
