Это приложение для Linux под названием PLEK, последний выпуск которого можно загрузить как PLEK.1.2.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием PLEK с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
ПЛЕК
Ad
ОПИСАНИЕ
МОНТАЖПредпосылка:
1. Линукс
2. Компилятор C / C ++ (т.е. gcc, g ++)
3. Python 2.5.0 или более поздние версии (http://www.python.org/)
Шаги:
1. Загрузите PLEK.1.2.tar.gz с https://sourceforge.net/projects/plek/files/
и распаковать его.
$ tar zvxf PLEK.1.2.tar.gz
2. Скомпилируйте PLEK.
$ кд ПЛЭК.1.2
$ Python PLEK_setup.py
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
python PLEK.py -fasta fasta_file -out output_file -thread количество_потоков
-minlength минимальная_длина_последовательности -isoutmsg 0_or_1 -isrmtempfile 0_or_1
Примеры:
1. $ python PLEK.py -fasta PLEK_test.fa -out предсказанный -thread 10
2. $ python PLEK.py -fasta PLEK_test.fa -out предсказал -thread 10 -minlength 150
=======================
Аймин Ли, доктор философии
Школа компьютерных наук и инженерии,
Сианьский технологический университет,
5 Южная Цзиньхуа-роуд,
Сиань, Шэньси 710048, КНР
Лиайминмейл АТ gmail.com
emanlee815 в 163.com
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/plek/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
