Это приложение для Linux под названием Pontos для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как Pontos-3.0.jar. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Pontos, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Pontos для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Pontos - это простая в использовании графическая программа на Java для расчета матриц нескорректированных расстояний (или сходства) на основе выравнивания последовательностей ДНК в формате PHYLIP. Это также создает "отличия" от обычных (и наоборот).Он может обрабатывать пробелы и неясности по-разному.
Пробелы могут быть:
- все б / у;
- все проигнорировано;
- игнорируется только в конце последовательностей попарно;
- игнорируется только на концах, но теперь глобально (фактически обрезая все выравнивание до самых дальних от концов последовательностей).
Неоднозначности (например, R, Y, N, W и т. Д. В последовательности ДНК) можно рассматривать как:
- рассматривать неоднозначности как всегда разные;
- рассматривать неоднозначность как частично отличную (например, R будет на 0.5 отличным от A или G);
- игнорировать неоднозначности при каждом попарном сравнении;
- глобально удалить все столбцы, в которых есть двусмысленность.
Pontos был написан в Linux, но должен работать в любой системе, где работает Java. Pontos находится под лицензией GPL версии 3.
Аудитория
Наука / Исследования, Конечные пользователи / Рабочий стол
Интерфейс пользователя
Java-свинг
Язык программирования
Java
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/pontos/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.